3.2麝香通心滴丸入血成分網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究

3.2.1作用靶點(diǎn)預(yù)測

將麝香通心滴丸8個(gè)入血成分上傳至PharmMapper數(shù)據(jù)庫后得到的所有靶點(diǎn)，刪除重復(fù)并整合得到作用靶點(diǎn)249個(gè)。通過與GeneCards數(shù)據(jù)庫中的1 778個(gè)與冠心病相關(guān)基因進(jìn)行匹配，并通過Ｒ軟件繪制韋恩圖，篩選出134個(gè)成分-疾病交集靶點(diǎn)，見表2、圖10。再通過Cytoscape 3.7.1軟件將8個(gè)入血成分與134個(gè)成分-疾病交集靶點(diǎn)相連，繪制出麝香通心滴丸的藥物-靶點(diǎn)相互作用的網(wǎng)絡(luò)圖，見圖11。

3.2.2蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與分析

將韋恩圖得到的134個(gè)交集基因輸入String數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行分析得到PPI圖，見圖12，其中包括134個(gè)節(jié)點(diǎn)，347條邊，平均節(jié)點(diǎn)度值為5.18，PPI富集P值少于1.0×1016，其中節(jié)點(diǎn)表示蛋白，每條邊則表示蛋白與蛋白之間的相互作用關(guān)系，線條越多表示關(guān)聯(lián)度越大。將String中下載的tsv文件用Ｒ語言進(jìn)行處理(以各蛋白連接的節(jié)點(diǎn)個(gè)數(shù)為指標(biāo)，列舉節(jié)點(diǎn)數(shù)排名前30個(gè)的蛋白)，得到PPI中的核心基因絲裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、酪氨酸激酶(SＲC)、磷脂酰肌醇3激酶(PIK3Ｒ1)等核心基因，見圖13。

3.2.3靶標(biāo)GO富集分析及通路富集分析結(jié)果

利用David 6.7平臺對134個(gè)藥物-疾病交集靶點(diǎn)進(jìn)行GO富集分析及通路富集分析。GO富集分析包括分子功能分析、細(xì)胞組分分析、生物學(xué)過程分析，以-lgP值進(jìn)行排名并列出排名前15的途徑，見圖14。在分子功能層面主要涉及類固醇激素受體活性、配體依賴性核受體活性等方面;在細(xì)胞組分層面主要涉及細(xì)胞外基質(zhì)、細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞質(zhì)囊泡等方面;生物學(xué)過程層面主要涉及有機(jī)物質(zhì)的反應(yīng)、內(nèi)源性刺激的反應(yīng)、激素刺激的反應(yīng)、調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖等方面。對富集得到的通路結(jié)果，以-lgP值及各通路連接的基因數(shù)從大到小進(jìn)行排名，見圖15。通過查閱文獻(xiàn)，該8個(gè)入血成分可能通過ErbB signaling pathway、VEGF signaling pathway、PPAＲsignaling pathway等信號通路治療冠心病。

3.2.4分子對接

將上述8個(gè)入血成分與上述互作關(guān)系排名前10的核心靶點(diǎn)進(jìn)行分子對接，結(jié)果見表3，結(jié)合能(affinity)越小則對接結(jié)果越好，affinity＜－7表示具有較好的結(jié)合活性，可見該8個(gè)入血成分與大多數(shù)核心靶點(diǎn)對接結(jié)果基本較好。其中，去乙酰華蟾毒精與MAPK1結(jié)合活性最高，其分子對接細(xì)節(jié)模擬見圖16，可知小分子結(jié)合在蛋白的活性口袋，并且有和活性口袋有較好的匹配。

聲明：本文所用圖片、文字來源《中成藥》2020年10月，版權(quán)歸原作者所有。如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)等問題，請與本網(wǎng)聯(lián)系

相關(guān)鏈接：蛋白，磷脂酰肌醇，類固醇，結(jié)合