北方偉業(yè)計量集團有限公司
沙門氏菌(Salmonella)是一種無芽孢、無莢膜的腸桿菌科革蘭氏陰性直桿菌,廣泛存在于人和動物腸道中,是全球范圍導致食源性疾病爆發(fā)的重要病原菌之一。在美國等發(fā)達國家,沙門氏菌感染的年發(fā)病率高達15.4%,由沙門氏菌引起的疾病爆發(fā)和住院治療均高于其他食源性細菌。在中國,每年約3億人次因感染沙門氏菌而患病,達病原菌食源性疾病總數(shù)的70%~80%,給食品安全和消費者健康帶來嚴重危害。
質(zhì)粒是獨立于染色體外、可自主復制、通常攜帶多種抗性和毒力基因的閉合環(huán)狀雙鏈DNA,質(zhì)粒的存在可使宿主菌產(chǎn)生耐藥性和致病性等附加特性。其中,接合質(zhì)粒是一種與耐藥基因水平傳遞和細菌耐藥性獲得的重要可移動元件。在眾多質(zhì)粒中,IncI1型質(zhì)粒有助于blaCTX-M-1基因在禽類和人之間散播,IncN型質(zhì)粒已被歐洲多個國家的研究者報道攜帶blaCTX-M-1基因。
本研究以分離于我國部分省市的食源、人源和動物源沙門氏菌為材料,篩選攜帶IncI1和IncN質(zhì)粒的菌株,闡明IncI1和IncN質(zhì)粒在沙門氏菌中的流行狀況,質(zhì)粒陽性菌株的藥敏性、與(氟)喹諾酮抗生素耐藥相關(guān)基因和超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(extended spectrum β-lactamases,ESBLs)編碼基因的檢出情況以及該2 種質(zhì)粒通過水平轉(zhuǎn)移傳播耐藥基因和耐藥性的水平,以期為保障微生物食品安全問題提供參考。
表1 菌株信息
所用菌株為實驗室保存的分離于北京、上海、福建、河南、四川、廣東、廣西、陜西和新疆等地各類零售食品、臨床病人和食品性動物的沙門氏菌(n=956)以及香港理工大學惠贈的攜帶IncI1(n=12)和IncN(n=2)的人源性沙門氏菌(表1)。
Luria-Bertani(LB)瓊脂、LB肉湯、Mueller Hinton瓊脂、麥康凱瓊脂 北京陸橋技術(shù)股份責任公司;XLT4培養(yǎng)基及其補充液 美國BD公司。
藥敏性測定用抗生素:萘啶酮酸(nalidixic acid,NAL)、環(huán)丙沙星(ciprofloxacin,CIP)、阿米卡星(amikacin,AMK)、硫酸慶大霉素(gentamicin,GEN)、鏈霉素(streptomycin,STR)、卡那霉素(kanamycin,KAN)、頭孢曲松(ceftriaxone,CRO)、頭孢西?。╟efoxitin,F(xiàn)OX)、頭孢噻呋(ceftiofur,TIO)、頭孢哌酮(cefoperazone,PER)、氨芐西林(ampicillin,AMP)、阿莫西林/克拉維酸(amoxicillin-clavulanic acid,AMC)、氯霉素(chloramphenicol,CHL)、四環(huán)素(tetracycline,TET)、復方新諾明(trimethoprim/sulfamethoxazole,SXT)和多黏菌素B(polymyxin B,PB)(均為分析純) 美國Sigma公司。
ESBLs編碼基因(blaTEM、blaCTX-M、blaOXA、blaACC和blaPSE)和質(zhì)粒介導的(氟)喹諾酮耐藥相關(guān)基因(qnrA、qnrB、qnrS、acc(6’)-Ib和qepA)擴增引物,IncN和IncI1不相容群質(zhì)粒PCR復制子分型用引物均由北京奧科鼎盛生物科技有限公司合成。
1 mol/L Tris-HCl(pH 8.0)、0.5 mol/L EDTA(pH 8.0)、5×TBE緩沖液、瓊脂糖凝膠、dNTP、PCR buffer、MgCl2、rTaqTM DNA Polymerase、DL2000 DNA Marker 寶生物工程(大連)有限公司。
Mycycler PCR儀、DNA電泳和凝膠成像系統(tǒng) 美國Bio-Rad公司;Milli-Q純水儀 法國Millpore公司;磁力加熱攪拌器 美國Fisher公司;微波爐 廣州美的微波爐制造有限公司;-40 ℃低溫冰箱、-80 ℃低溫冰箱日本Sanyo公司;百分之一天平、萬分之一天平 德國賽多利斯公司;立式壓力蒸汽滅菌器 上海申安高壓儀器設(shè)備有限公司;隔水式恒溫培養(yǎng)箱 北京科偉實驗儀器有限公司;移液器、高速離心機 德國Eppendorf公司;生物安全柜 美國Labgard公司;超凈工作臺蘇州凈化設(shè)備有限公司;濁度儀 美國DADE Behring公司;數(shù)顯恒溫水浴鍋 北京科偉試驗儀器有限公司;恒溫搖床 上海智誠分析儀器制造有限公司。
基于PCR復制子分型方法對質(zhì)粒進行不相容群分析,用單一PCR法篩選攜帶IncI1和IncN不相容群質(zhì)粒的菌株。采用煮沸法制備DNA模板。PCR條件:94 ℃預變性10 min;94 ℃變性1 min,相應退火溫度條件下1 min、72 ℃延伸1 min,35 個循環(huán);72 ℃延伸10 min。退火溫度由相應基因的引物序列決定。2 μL PCR產(chǎn)物經(jīng)凝膠電泳和溴化乙錠染色后于凝膠成像系統(tǒng)下檢測。在低溫條件下將PCR粗產(chǎn)物送至上海桑尼生物科技有限公司測序,采用在線比對軟件BLAST進行比對,確定質(zhì)粒類型。
采用美國國家臨床實驗室標準化委員會(Clinical and Laboratory Standards Institution,CLSI推薦使用的瓊脂稀釋法,測定供試抗生素對沙門氏菌的最小抑菌濃度(minimum inhibitory concentrations,MIC),參考CLSI的標準解讀藥敏性測定結(jié)果。
采用普通PCR檢測相關(guān)耐藥基因,引物如表2所示,PCR模板(菌株總DNA)、擴增體系和具體條件
基于IncI1和IncN質(zhì)粒陽性菌株及受體菌藥敏性結(jié)果,選擇分別攜帶IncI1質(zhì)粒和IncN質(zhì)粒的沙門氏菌作為供體菌,不含該2 種質(zhì)粒的大腸桿菌和沙門氏菌為受體菌,采用膜過濾法進行接合。接合方法如下:取OD600 nm為0.6的供體菌和受體菌菌液各1 mL于5 mL LB肉湯中混勻,轉(zhuǎn)入孔徑0.22 μm的濾器過濾,過濾后將濾膜緊貼于不含抗生素的LB瓊脂培養(yǎng)基表面,有菌的一面向上,37 ℃過夜培養(yǎng)。用5 mL LB肉湯清洗過夜培養(yǎng)的濾膜,梯度稀釋后分別涂布于同時含有CRO(32 μg/mL)和CIP(16 μg/mL)或同時含有STR(64 μg/mL)和CIP(16 μg/mL)的LB平板上,雙抗平板的選擇根據(jù)供體菌和受體菌的耐藥表型確定,每個梯度3 個平行,37 ℃培養(yǎng)48 h,計數(shù)。
將OD600 nm為0.6的受體菌梯度稀釋后均勻涂布于不含抗生素的LB平板,每個梯度3 個平行,37 ℃培養(yǎng)過夜,計數(shù),用于菌液起始濃度的確定。同時,將供體菌和受體菌分別涂布于相應的雙抗平板上,每株菌3 個平行,37 ℃培養(yǎng)48 h,作為對照。培養(yǎng)結(jié)束后,確定供體菌和受體菌不能在相應的雙抗平板上生長時,再在涂布有不同稀釋度接合子的雙抗平板上隨機挑選10 個單菌落,以表2中的引物進行PCR擴增,擴增產(chǎn)物采用1%的瓊脂糖凝膠進行電泳和測序分析,確定IncI1和IncN質(zhì)粒在接合過程發(fā)生了水平轉(zhuǎn)移。接合子攜帶的耐藥基因和藥敏性檢測方法同1.3.1節(jié)和1.3.2節(jié)。接合頻率計算公式如下:
式中:T為陽性接合子平均菌落數(shù);R為受體菌平均菌落數(shù)。
利用Minitab®18.1對實驗數(shù)據(jù)進行處理,用χ2檢驗比較不同條件下的檢出率,P<0.05,差異顯著。
相關(guān)鏈接:沙門氏菌,β-內(nèi)酰胺酶,抗生素,硫酸慶大霉素,環(huán)丙沙星,多黏菌素B,菌株,偉業(yè)計量
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