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溶酶體靶向嵌合體,有望為一系列疾病開發(fā)出新型蛋白降解策略

發(fā)布時(shí)間:2020-08-03 09:27 編輯者:潘東海

當(dāng)科學(xué)家們在細(xì)胞上發(fā)現(xiàn)潛在的危險(xiǎn)蛋白時(shí),他們可能會(huì)想象將自己縮小成為小小的外科醫(yī)生,只切除有問題的蛋白分子,而將細(xì)胞的健康細(xì)胞完整地保留下來。在一項(xiàng)新的研究中,來自美國斯坦福大學(xué)的研究人員指出,雖然靈巧的雙手和鋒利的器械永遠(yuǎn)無法從細(xì)胞表面上切除單個(gè)蛋白,但是一種新的分子工具可以讓細(xì)胞外科手術(shù)變得更容易。

這些作者開發(fā)出一類新的分子,它們可以將不需要的蛋白從細(xì)胞表面或周圍環(huán)境中穿梭到溶酶體中,其中溶酶體是專門用于蛋白降解的細(xì)胞區(qū)室。這些分子稱為溶酶體靶向嵌合體(lysosome targeting chimera, LYTAC),它們的工作機(jī)理是選擇性地用標(biāo)簽標(biāo)記蛋白,這個(gè)標(biāo)簽決定了蛋白的命運(yùn),使之作為細(xì)胞垃圾進(jìn)行降解。這種選擇性降解可以幫助科學(xué)家們研究和治療癌癥和阿爾茨海默病等疾病,這些疾病的病因與表面蛋白有關(guān)。

論文第一作者、斯坦福大學(xué)人文科學(xué)學(xué)院Carolyn Bertozzi教授實(shí)驗(yàn)室的博士后研究員Steven Banik說,“這就像一把分子手術(shù)刀。這種工具允許你加快細(xì)胞上或細(xì)胞外的所有蛋白中的某種蛋白的自然降解。”

蛋白對許多生物過程至關(guān)重要,比如代謝和細(xì)胞間交流,但有些蛋白也會(huì)幫助癌癥等疾病擴(kuò)散,逃避免疫調(diào)節(jié)。當(dāng)?shù)鞍装l(fā)揮作用時(shí),其他細(xì)胞成分可以停靠到它的活性位點(diǎn)。阻礙這些不好蛋白的傳統(tǒng)方法涉及使用阻斷蛋白活性位點(diǎn)的藥物,這通常是通過移動(dòng)原子來實(shí)現(xiàn)的。但這種阻斷策略并不完美,有時(shí)結(jié)合口袋太淺,抑制劑被太快彈出。在其他時(shí)候,蛋白的活性來自于它的物理特性,比如它的剛性,而不是來自于任何活性位點(diǎn),所以阻斷整個(gè)蛋白的一小部分是不夠的。在這些情況下,將蛋白從細(xì)胞中排出是唯一的選擇。

自從20年前人們開發(fā)出蛋白水解靶向嵌合體(proteolysis targeting chimera, PROTAC)以來,蛋白降解作為一種治療策略特別受歡迎。PROTAC尋找并標(biāo)記細(xì)胞內(nèi)蛋白使之隨后遭受降解,在研究實(shí)驗(yàn)室和早期的臨床研究中取得了成功,但它們依靠的是一種降解途徑,而這種途徑對大約40%位于細(xì)胞膜上或細(xì)胞膜外的蛋白來說是不可觸及的。Bertozzi和Banik并沒有接受某些蛋白--以及疾病--是遙不可及的說法。

Bertozzi說,“我的實(shí)驗(yàn)室一直對細(xì)胞表面上發(fā)生的事情感興趣,這其中就包括對免疫調(diào)節(jié)很重要的蛋白。我們已鑒定出許多我們認(rèn)為在癌癥中發(fā)揮致病作用的細(xì)胞表面蛋白和分泌蛋白,LYTAC可以幫助我們更好地理解它們,并探索將它們作為藥物靶點(diǎn)。”

讓這種工具發(fā)揮作用的關(guān)鍵在于它的雙功能設(shè)計(jì)。LYTAC分子的一側(cè)可以定制,與任何感興趣的蛋白結(jié)合。它的另一側(cè)是一個(gè)短的氨基酸序列,或者說是肽,上面鑲嵌著一種叫做甘露糖-6-磷酸(mannose-6-phosphate)的糖。

這種糖作為細(xì)胞的記賬標(biāo)簽。當(dāng)細(xì)胞含有送到溶酶體中進(jìn)行降解的蛋白時(shí),它就會(huì)添加上這種糖,以確保它們到達(dá)目的地。Banik說,“甘露糖-6-磷酸的作用就像一個(gè)郵政編碼。這種糖告訴細(xì)胞,‘我要把這種蛋白帶到溶酶體。請把我送到那里去。’”細(xì)胞表面有受體與這種糖相互作用,當(dāng)它們抓住LYTAC分子并把它拉進(jìn)細(xì)胞時(shí),被標(biāo)記的蛋白也會(huì)跟著它一起被拖進(jìn)來。

在將這種標(biāo)簽附著在蛋白上的過程中,LYTAC劫持了一種天然的細(xì)胞穿梭機(jī)制,該機(jī)制旨在護(hù)送新合成的溶酶體蛋白到它們的新家。但是,溶酶體蛋白足夠堅(jiān)韌,可以在溶酶體中遇到的降解酶存在下存活下來,而大多數(shù)蛋白卻不能做到這一點(diǎn),因此那些被LYTAC方法標(biāo)記的蛋白通常會(huì)被破壞。

這些研究人員證實(shí)在細(xì)胞中,他們可以靶向并降解在阿爾茨海默病和癌癥中起著重要作用的蛋白。根據(jù)他們的說法,LYTAC的蛋白拴系端可以是任何與蛋白結(jié)合的東西,比如抗體或現(xiàn)有的藥物,所以在未來,許多其他蛋白和疾病都可以被攻擊。

Bertozzi說,“有了蛋白降解策略,你不僅可以擴(kuò)大藥物可靶向(druggable)的靶細(xì)胞數(shù)量,還可以改進(jìn)已有的療法。每個(gè)細(xì)胞都有溶酶體。每個(gè)細(xì)胞都已經(jīng)有了降解蛋白的方法。無論你的靶標(biāo)是什么,如果你能讓LYTAC到達(dá)那里,你就能降解它。”

文章來源于網(wǎng)絡(luò)

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